Археолошко одјељење Музеја Херцеговине формирано је у вријеме оснивања Mузеја
1952. године, када је почело прикупљање експоната за музејске збирке. У периоду од
неколико наредних година, пописани су и хронолошки опредијељени предмети,
урађене инвентарне књиге, картотека музејских предмета и
фототека за снимке споменика са терена.

Умјетничко одјељење у Музеју Херцеговине Требиње обилује прилично великим бројем
умјетничких предмета. Видно мјесто међу њима имају умјетничке слике, скулптуре,
графике и цртежи. Ово одјељење стално допуњује своје збирке, било откупима,
било поклонима. За сада посједује око 1000 експоната. Од тога су велики дио поклон-збирке.

Сакупљање етнографског материјала у Музеју Хегсеговине у Требињу
(до 1994. године Завичајни музеj у Требињу) започето је послије
Другог свјетског рата 1952. године. Од тада до данас многи стручњаци:
историчари умјетности, историчари, географи, археолози, као и љубитељи
народног живота, настојали су да, у оквиру материјалних, кадровских и
просторних могућности, раде на сакупљању и обради етнографских предмета.

Музеј након оснивања 1952. године замишљен је по концепцији да буде комплексног карактера.
Зато је био потребан уједначен рад на попуњавању свих збирки: археолошке,
етнографске, збирке умјетничких слика а посебно историјске збирке, јер, требињски крај
и град Требиње има богату и бурну прошлост. То је крај у коме су се смјењивале цивилизације,
народи и државе, те се сукобљавали разни културни и други утицаји.

Природњачко одјељење је најмлађе одјељење Музеја Херцеговине Требиње.
У вријеме кад је Музеј основан (1955. године) као Завичајни Музеј за срез Требиње,
организован је као установа комплесног типа кoja у свом саставу има: археолошку,
етнографску, умјетничку и историјску збирку.